El área de Ciencias Naturales está conformada por las asignaturas de Ciencias Naturales, Química, Física y Biología. Los docentes a cargo trabajan activamente para lograr que los estudiantes interpreten el entorno en un contexto científico y social, generando constante debate, sustentación y argumentación. Para lograr este objetivo, la UEPSDA hace uso de diversos recursos de enseñanza como: modelos moleculares, software físico-químicos, aplicaciones de modelaje molecular, además de, un completo laboratorio que permite la ejecución de experimentos químicos, físicos y biológicos que acercan al estudiante al contexto de la realidad y lo preparan para enfrentar retos académicos complejos, así como solucionar problemas cotidianos, siendo ciudadanos con criterios técnicos, metodológicos y científicos, conscientes y respetuosos de la naturaleza.